اولين شماره مجله با نام "نشريه تحقيقات نهــال و بــذر " در سال 1359 منتشر شد . تا سال 1369 شش جلد از مجله منتشر شد و از سال 1370 انتشار آن به طور منظم ادامه يافت . در سال 1376 درجه علمي- پژوهشي را از وزارت علوم، تحقيقات و فناوري کسب كرد . در راستاي تخصصي شدن بيشترمجلات علمي - پژوهشي و بر اساس برنامه ارائه شده از طرف كميسيون نشريات علمي كشور ، در سا ل1387مجله نهال و بذر در دو گرايش 1- به نژادي 2- به زراعي و فيزيولوژي و هر گرايش در شماره هاي جداگانه منتشر شد.
در ادامه اين برنامه از سال 1388 مجله نهال و بذر به صورت دو مجله جداگانه با عنوا ن هاي زير چاپ و منتشر مي شود:
1- مجله به نژادي نهـال و بــذر (1-25)
( Seed and Plant Improvement Journal (SPIJ
2- مجله به زراعي نهــال و بــذر (جلد2-25)
(Seed and Plant Production Journal (SPPJ
مقالات مربوط به به نژادي در مجله با كد 1 و مقالات به زراعي در مجله با كد 2 چاپ خواهند شد.
مقالات كامل هر دو مجله در پايگاه استنادي علوم ايران و جهان اسلام (ISC ) به آدرس http://www.srlst.com، پايگاه اطلاعات علمي جهاد دانشگاهي به آدرس http://www.sid.ir و پایگاه www.agrisis.ir و خلاصه مقالات آن در پایگاه http://www.cabi.com نمایه می شود.
در پایگاه اختصاصی http://www.seedandplant.ir نیز مقالات و اطلاعات مربوط به این مجلات قابل دسترسی است.